腹腔鏡手術では、腹部に5－12mmの大きさの小孔を4－5個開け、トロカーという手術器具を出し入れするための筒を挿入します。
腹腔内に炭酸ガスを注入し、腹部を膨らませて、手術をするスペースを作ります。トロカーからカメラや手術器具を挿入し、患部を拡大してモニターに映しながら、繊細な手術を行います。出血量も開腹手術にくらべると、少ないと言われています。

摘出臓器は、トロカーの小穴の一つを臓器が最低限通る大きさに延長して、取り出します（腹腔鏡下腎尿管全摘の場合は、腎の遊離は腹腔鏡手術、尿管下端の処理は骨盤側の創から開腹手術で行い、骨盤側の開腹手術の創から腎臓を摘出します）。腹腔鏡手術の創は、開腹手術よりも小さく、手術後の痛みが少ないため、回復が早く、患者さんの負担軽減につながると考えられます。